鸣人作为核心角色拥有多种组队搭配方案，其技能特性决定了与不同忍者的协同效果。鸣人的影分身和螺旋丸技能具备击飞与浮空特性，适合衔接高爆发或控制型队友的连招。与宇智波佐助的千鸟系列技能配合时，可通过螺旋丸起手制造浮空，佐助接千鸟锐枪形成长连击链。鸣人的奥义两千连弹具有大范围伤害，能为队友创造输出环境，因此搭配范围型奥义忍者如我爱罗的沙暴大葬可快速清场。
鸣人与春野樱的组队能形成攻守兼备的体系。小樱的怪力攻击可弥补鸣人近身战的硬直间隙，而她的治疗能力能保障鸣人在持续作战中的生存。当面对BOSS战时，这种组合尤其有效，小樱的樱花冲可打断BOSS技能，为鸣人提供安全的奥义蓄力时间。鸣人与日向雏田的柔拳配合也能产生特殊效果，雏田的八卦空掌可远程触发鸣人影分身的追击，形成交叉火力压制。
在九尾查克拉模式下，鸣人的阵容适配性进一步提升。该状态下免疫不良状态的特性使其能与依赖debuff的忍者如奈良鹿丸完美配合。鹿丸的影子模仿术控制敌人后，鸣人可无顾虑地释放大玉螺旋丸等高前摇技能。九尾鸣人的查克拉补给被动能支持查克拉消耗型队友如旗木卡卡西频繁使用雷切，形成技能循环压制。若搭配千手纲手，其暴击加成还能放大鸣人多重影分身的输出上限。
特殊剧情关卡中，鸣人与宇智波佐助、大天地桥小队组合具有战略意义。大木遁·树界降临能制造地形限制，配合佐助的天照和鸣人的风遁·螺旋手里剑可实现属性融合攻击。这种组合在对抗大筒木一式等强敌时，能通过交替控制与爆发输出瓦解敌方防御。而鸣人与漩涡博人的父子组合则拥有独特的羁绊加成，博人的科学忍具与鸣人的传统忍术能形成时空交错式的复合打击。
鸣人的组队逻辑需围绕其技能特性展开，优先选择能弥补其技能间隙或放大连击优势的忍者。从基础的双人配合到复杂的三人战术，合理利用击飞、浮空、查克拉补给等机制，可构建出适应不同战斗场景的强力阵容。
